Het repertoire van Trio Cortado is even uitgebreid als veelzijdig. Ongebonden als het ensemble is aan repertoire dat oorspronkelijk geschreven is voor deze bezetting, zoeken de leden van het Trio continu naar nieuwe, verrassende mogelijkheden voor deze drie instrumenten. Zo staan er inmiddels zulke uiteenlopende dingen op de lessenaar als ensemblemuziek uit de Franse barok, zoals de Concerts Royaux van Couperin, impressionistische pianomuziek zoals de Préludes van Debussy, strijktrio's van Beethoven en Mozart, of het strijkduo van Ravel.
Ook de hedendaagse muziek blijft niet onderbelicht. Werken van Carter, Shchedrin en Stockhausen worden aangevuld met de drie opdrachtcomposities heeft Trio Cortado inmiddels op zijn naam staan: Slot Machine (2013) van Christiaan Richter, Unpretentious but Virtuosic Minutes (2013) van Leonard Evers, en End of Summer (2014) van Ruben Naeff.